Villa Zito a été construite au début du XVIII siècle par Gaspare Scichili, elle fut la demeure des princes de Carini qui l'habitèrent jusqu'à la moitié du XIX siècle; en ce temps-là la Villa donnait l'impression d'un édifice néoclassique qu'elle garde encore. En 1906 l'édifice et le Jardin furent vendus au chevalier Francesco Zito qui donna beaucoup d'attention au palais en améliorant le périmètre extérieur.
Au début du XX siècle, le bâtiment fut acheté par la Banque de Sicile et il fut destiné à siège des bureaux, mais ensuite, la même Banque pensa d'utileser la ville pour des autres buts. À partir de 1958, la Banque initia une activité très importante pour favoriser l'archéologie sicilienne. La prémiere manifestation de cet intêret on peut la trouver dans la demande d'obtenir quelques pièces archéologiques pour les exposer dans les salles de la Banque.
Le Ministère de l'Education Nationale, après la proposition favorable de la locale Direction aux Antiquités, donna 320 pièces, en dépôt temporaire, provenantes, surtout, des nécropoles de la Sicile, (nécropole de Selinunte) et représentantes les mœurs et les habitudes de la gens sicilienne à ce temps-là.
Quelques uns de ces vestiges ont eu besoin de restaurations, gerés par la Banque, et donc ce fut possible d'éxposer les pièces dans de spéciales vitrines, près les locaux de la Banque destinés à musée et qui furent ouverts au public. Ces pièces constituèrent le prémier noyau du musée qui dès ce moment continua son enrichement en qualité et en quantité de l' exposition, en évitant que du matériel archèologique très important pût être transferé dans les musées étrangers. La collection de céramiques, gardées à l'interieur du musée, répresente une grande documentation de maïoliques siciliennes, provenantes de fabriques palermitaines, de Trapani, de Burgio, de Caltagirone et qui remontent au XVI, XVII et XVIII siècles.
Le musée garde une collection numismatique: on y trouve des pièces, un groupe de médailles de la Sicile et une Bibliothéque Numismatique qui présente, aussi, des livres collectionés par le roi Vittorio Emanuele III. Il est beau de visiter aussi le secteur dedié à la philatélie, où on peut trouver d'anciennes gravures qui remontent au Royaume de Deux Sicilies; des cartes géographiques, d'anciens timbres ed des plans siciliens du XVII et du XIX siècles.
À l'interieur du musée, il y a les instruments qui lui permettent de bien fonctionner: une Photothèque et une Bibliothèque. La Bibliothèque garde de precieuses raretés, un fichier des œvres imprimées en Italie et à l'ètranger, des vestiges bibliographiques de Narbone et de Mira; les dictionnaires de Traina et de Mortillaro et toutes les documentations italiennes et étrangères sur l'Archéologie.
Parmi les raretés les plus precieuses on trouve les oeuvres des artistes qui ont visité la Sicilie, comme Saint Non , auteur du "Voyage pittoresque", Osterwall et Houel.